Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fam107bQ3TGF2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fam107bQ3TGF2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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