Protein–RNA interactions for Protein: Q3TEA8

Hp1bp3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hp1bp3Q3TEA8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hp1bp3Q3TEA8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms