Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hddc2Q3SXD3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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