Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Treml4Q3LRV9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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