Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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H2-M3Q31093 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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H2-M3Q31093 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M3Q31093 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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H2-M3Q31093 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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H2-M3Q31093 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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H2-M3Q31093 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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H2-M3Q31093 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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H2-M3Q31093 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M3Q31093 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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H2-M3Q31093 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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H2-M3Q31093 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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