Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam178bQ24JP3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam178bQ24JP3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
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