Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Shroom4Q1W617 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Shroom4Q1W617 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms