Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne9Q1RLL3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne9Q1RLL3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms