Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ptcd3Q14C51 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ptcd3Q14C51 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms