Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ptchd1Q14B62 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ptchd1Q14B62 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ptchd1Q14B62 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ptchd1Q14B62 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ptchd1Q14B62 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ptchd1Q14B62 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ptchd1Q14B62 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ptchd1Q14B62 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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ptchd1Q14B62 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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