Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd3Q14AI6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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