Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rpusd2Q149F1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpusd2Q149F1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Rpusd2Q149F1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms