Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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Traf3ip1Q149C2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Traf3ip1Q149C2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms