Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gli2Q0VGT2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms