Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Atp2b3Q0VF55 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Atp2b3Q0VF55 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms