Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rundc1Q0VDN7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms