Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vps8Q0P5W1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps8Q0P5W1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms