Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
1700061G19RikQ08EE8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms