Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MitfQ08874 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
MitfQ08874 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
MitfQ08874 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms