Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tff1Q08423 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Tff1Q08423 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tff1Q08423 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tff1Q08423 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Tff1Q08423 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tff1Q08423 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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