Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ebf1Q07802 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ebf1Q07802 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms