Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Col9a2Q07643 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms