Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gdf9Q07105 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms