Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Siah1bQ06985 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Siah1bQ06985 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms