Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sox4Q06831 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms