Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Prrx2Q06348 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms