Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPINDOCQ05AH6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPINDOCQ05AH6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms