Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Thbs3Q05895 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Thbs3Q05895 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Thbs3Q05895 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Thbs3Q05895 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Thbs3Q05895 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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