Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Fmn1Q05860 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Fmn1Q05860 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms