Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox12Q04890 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox12Q04890 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox12Q04890 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox12Q04890 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox12Q04890 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox12Q04890 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox12Q04890 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sox12Q04890 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sox12Q04890 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox12Q04890 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox12Q04890 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox12Q04890 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox12Q04890 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sox12Q04890 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox12Q04890 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sox12Q04890 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sox12Q04890 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 Olfr1281-201ENSMUST00000090326 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sox12Q04890 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sox12Q04890 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox12Q04890 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox12Q04890 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sox12Q04890 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox12Q04890 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sox12Q04890 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox12Q04890 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sox12Q04890 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sox12Q04890 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms