Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nf1Q04690 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Nf1Q04690 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Nf1Q04690 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms