Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tff2Q03404 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms