Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Hivep1Q03172 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Hivep1Q03172 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms