Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pax5Q02650 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms