Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Grin2bQ01097 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grin2bQ01097 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms