Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pde1bQ01065 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms