Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms