Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Serpina1cQ00896 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpina1cQ00896 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms