Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VegfaQ00731 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms