Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itga4Q00651 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms