Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pax8Q00288 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms