Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms