Protein–RNA interactions for Protein: P97953

Vegfc, Vascular endothelial growth factor C, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfcP97953 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VegfcP97953 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VegfcP97953 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms