Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AlkP97793 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AlkP97793 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlkP97793 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlkP97793 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlkP97793 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlkP97793 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AlkP97793 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AlkP97793 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AlkP97793 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlkP97793 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlkP97793 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlkP97793 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlkP97793 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlkP97793 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlkP97793 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlkP97793 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AlkP97793 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlkP97793 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlkP97793 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlkP97793 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlkP97793 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlkP97793 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlkP97793 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlkP97793 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AlkP97793 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AlkP97793 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlkP97793 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlkP97793 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlkP97793 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlkP97793 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlkP97793 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AlkP97793 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AlkP97793 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlkP97793 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlkP97793 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlkP97793 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlkP97793 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlkP97793 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlkP97793 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlkP97793 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlkP97793 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlkP97793 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlkP97793 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlkP97793 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlkP97793 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlkP97793 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AlkP97793 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AlkP97793 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AlkP97793 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AlkP97793 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AlkP97793 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AlkP97793 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AlkP97793 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AlkP97793 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AlkP97793 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AlkP97793 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AlkP97793 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AlkP97793 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AlkP97793 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AlkP97793 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AlkP97793 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AlkP97793 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AlkP97793 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AlkP97793 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AlkP97793 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AlkP97793 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AlkP97793 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AlkP97793 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AlkP97793 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AlkP97793 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms