Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
rp9P97762 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
rp9P97762 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
rp9P97762 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
rp9P97762 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
rp9P97762 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
rp9P97762 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
rp9P97762 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
rp9P97762 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
rp9P97762 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
rp9P97762 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
rp9P97762 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
rp9P97762 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
rp9P97762 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
rp9P97762 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
rp9P97762 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
rp9P97762 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
rp9P97762 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
rp9P97762 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
rp9P97762 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
rp9P97762 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
rp9P97762 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
rp9P97762 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
rp9P97762 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
rp9P97762 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
rp9P97762 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
rp9P97762 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
rp9P97762 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
rp9P97762 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
rp9P97762 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms