Protein–RNA interactions for Protein: P97460

Npas2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas2P97460 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Npas2P97460 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas2P97460 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas2P97460 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas2P97460 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Npas2P97460 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas2P97460 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Npas2P97460 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms