Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vps45P97390 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms