Protein–RNA interactions for Protein: P97376

Frg1, Protein FRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg1P97376 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Frg1P97376 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frg1P97376 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frg1P97376 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frg1P97376 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frg1P97376 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frg1P97376 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Frg1P97376 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frg1P97376 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frg1P97376 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frg1P97376 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frg1P97376 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frg1P97376 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frg1P97376 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frg1P97376 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frg1P97376 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frg1P97376 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frg1P97376 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Frg1P97376 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms