Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme1P97371 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme1P97371 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme1P97371 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme1P97371 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme1P97371 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme1P97371 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme1P97371 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psme1P97371 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Psme1P97371 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms