Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec1P97353 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec1P97353 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec1P97353 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms